UCSC基因组浏览器简介

UCSC基因组浏览器是由加利福尼亚大学圣克鲁兹分校(University of California, Santa Cruz)开发并维护的在线基因组浏览工具。自2000年推出以来,该浏览器为研究人员提供了多种物种的基因组序列数据及其相关注释,支持快速、交互式地查看和分析基因组信息。

UCSC基因组浏览器官网网址:https://genome.ucsc.edu/

UCSC基因组浏览器的主要功能

  • 多物种基因组数据:涵盖人类、小鼠、斑马鱼等多种物种的基因组序列和注释信息,方便用户进行跨物种比较研究。
  • 丰富的注释轨道:提供基因预测、mRNA比对、重复序列、SNPs等多种注释轨道,用户可根据研究需求自定义显示。
  • 自定义数据上传:支持用户上传自定义轨道(Custom Tracks),将自己的数据与参考基因组进行比较和可视化。
  • 序列比对工具:内置BLAT(BLAST-Like Alignment Tool)等工具,支持快速序列比对,帮助用户定位特定序列在基因组中的位置。
  • 数据下载与共享:提供多种格式的数据下载选项,支持用户保存和分享特定的基因组浏览视图。

UCSC基因组浏览器的特色

  • 交互式界面:用户可通过放大、缩小、拖动等操作,灵活查看基因组的不同区域和层次信息。
  • 多层次数据集成:将多种类型的数据集成在同一视图中,方便用户进行综合分析。
  • 持续更新:定期更新基因组数据和注释,确保用户获取研究成果和信息。

3、描述:提供多物种基因组序列和注释信息的在线浏览工具

数据统计

数据评估

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关于UCSC基因组浏览器特别声明

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